意外发现耿鬼能够超级巨化的小智，在樱木所长的建议下前往伽勒尔的溯传镇，去寻找溯传镇幽灵道馆馆主欧尼奥。
到达伽勒尔地区的小智与皮卡丘连同超梦和耿鬼准备搭上前往溯传镇的列车，在列车站小智意外撞到了一名少年，少年受惊般迅速跑走，却意外的将车票掉落在地，小智立刻捡起车票和皮卡丘祂们跟上少年。
少年跑的很快，小智也是一点不落的跟上，就这么跑到了地下的一个车站，少年已然不见踪迹，这时列车的喇叭响起：0号月台，前往溯传镇的列车即将出发，请要搭乘的旅客做好准备。
小智带着皮卡丘也不犹豫直接上了面前的列车，超梦与耿鬼也是跟了上去。
“幽灵列即将车启动，请勿强行进入车厢。”列车内小智看了眼车票上的座位，向着一号包厢走去，途中小智看到了一个豪华的包间，却未停留，继续前往下一个车厢，走过一个又一个空旷的车厢，小智有些纳闷，随后想了想还是决定继续往前走，再次进入一个车厢一群飘飘球出现在小智面前。
飘飘球好奇的凑近小智，只觉得面前少年身上的气息很舒服，便绕着小智转了转圈，更有些胆大的飘飘球兀自飘到小智面前，示意小智抓住祂们的绳子，小智虽然好奇但还是伸手抓住，飘飘球在被小智握到手里，便带着小智玩耍起来，玩了一会儿，在超梦的提醒下，小智也和飘飘球们告别进入了下一节车厢。
新一节车厢内似乎像一个小小的公园，奇形怪状的树木生长着，更有南瓜精正漂浮着，南瓜精再见到小智也是纷纷凑了过来，将小智绕了一圈又一圈，随后又散去，小智这时才看见自泥土里爬出许多土居忍士，从泥土中出现的土居忍士纷纷进化成了铁面忍者。
看着面前这一幕小智惊讶了，他第一次看见那么多土居忍士进化，铁面忍者进化之后围着列车窗户打转，小智见此让皮卡丘使用十万伏特打碎了窗户，铁面忍者也因此从窗户中飞了出去，小智在窗户边同铁面忍者挥了挥手，这时小智的洛托姆图鉴响起：脱壳忍者资料已登陆。小智惊讶拿出精灵球放出了脱壳忍者，之后拿出洛托姆图鉴：脱壳忍者，空壳宝可梦，是虫和幽灵属性，祂是一种在土居忍士进化时不知不觉会出现在精灵球内的宝可梦。
小智伸手，脱壳忍者飞到小智手上贴了贴小智的大拇指，看着这个小巧的宝可梦小智笑了笑：“以后请多指教了，脱壳忍者。”之后小智将脱壳忍者收回精灵球带着皮卡丘祂们继续前往下一节车厢。
还未等小智出发，面前的列车门就打开了，那名少年出现在小智面前，小智上前将捡到的车票递给他。
“不好意思，因为捡到了你的车票就想着还给你，然后我也上了这趟列车。”小智颇为不好意思的道。
少年摇了摇头表示没关系，随后将小智领到了他所在的车厢。
少年在见到南瓜精不远不近的跟着小智道：“祂们好像很喜欢你。”
“我也很惊讶呢。”小智挠了挠头道。“对了，我是小智，很高兴认识你。”
“很高兴…么？”少年愣了愣。
“对的，没错！”小智看着少年，真诚道。
还未等少年说些什么，列车停了下来，属于豪华包厢的门，一群鬼斯通带着先前小智看到的那块石头离开了。
小智疑惑。
“那个是花岩石。”少年见着小智疑惑的表情解答着，小智也将此次前往溯传镇的原因说了下，换来少年愣愣的目光，小智虽然疑惑，但也很快抛之脑后，就这么两人聊了许久，直到最后到达溯传镇，小智仍然不知道少年叫什么，在小智下了列车后，那辆列车以及少年都不见了踪迹，小智一度以为以及出现了错觉但是到达的溯传镇，以及收服的脱壳忍者都在告诉他这是真。
小智也不再多想，向着溯传镇的幽灵道馆而去。
聊天群内
【梦幻：妙~这个幽灵列车看起来好好玩的样子】
【胡帕：胡帕也觉得很有意思，很好玩的样子】
【拉帝亚斯：没错，没错】
【谢米：咪也觉得，或许哪天咪也可以去试试这个幽灵列车】
【凤王：我倒是觉得那个少年很奇特】
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